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미국북장로교 선교사 H.N.Alen 의사가 입국하여 의료선교로 복음전도의 길을 열고 1885.4. 5 H.G Underwood 선교사의 입국으로 장로교 선교는 활발히 시작되었다. 1893. 1. 장로회 선교사 공의회가 조직되고
1901. 5. 15 평양 장로회 신학교 개교, 1907. 9. 17 조선예수교장로회 독노회가 조직되어 장로교 교회 확장은 잘 되었으나 1932년부터 일기 시작한 신사참배 강요로 기독교 학교가 어려움을 겪고 1938. 9.10 제27회 총회는 신사참배 하기로
가결하니 진리를 수호하는 주의 신실한 종들은 신사참배 반대운동을 전개하였다.

평양 장로회 신학교가 문을 닫고 주기철, 한상동, 주남선 목사 등은 검속되어 평양형무소에서 옥고를 치루다가 주기철목사 등 많은 분들이 순교하고 한상동, 주남선 목사, 손명복, 조수옥전도사등은 평양형무소에서, 손양원 목사는 청주 감옥에서 1945. 8. 15 해방을 맞아 출옥하였다. 이들은 한국교회 재건의 주역이 되었고, 순수한 개혁주의 보수신학교를 세우기로 하고 1946. 6. 23 진해에서 하기신학강좌를 개최하고 9. 20에 고려신학교를 개교하였다.

1948. 4. 제 34회 총회는 고려신학교 학생 추천문제를 [고려신학교는 총회와 아무런 관계가 없기 때문에 노회가 천서를 줄 수 없다] 하여 문제가 제기되고 이때부터 총회 내엔 출옥성도들이 중심된 고려신학교를 거세하려는 움직임이 일기 시작하고 장로교 분열의 움직임이 보이기 시작하였다.
 
12. 손양원 목사 고려신학교 총무로 취임.
4. 경남노회는 출옥성도들을 거북스럽게 여기는 친일목사들의 세력이 점차 확산되고 고려신학교 천서 문제를 반대하여 오다가 경남노회는 5개가 되었다.
4. 21
제36회 총회는 경남노회 총대문제로 개회벽두부터 소란이 일다가 급기야는 경찰이 동원되어 진압이 되고 총회는 유회가 되었다. 그리고 2개월 후 6. 25전쟁이 터졌다.
9. 28
 고려신학교 총무 손양원 목사 순교.
장례는 고려고등성경학교 오종덕 목사 집례.
고려신학교 교장 박윤선 목사가 설교하다.
3. 23 고려신학교 설립자 중 한 분인 출옥성도 주남선 목사 별세
5.
 25 제36회 총회시 고려신학교를 지지하는 경남(법통)노회 총대가 받아들여지지 않고 경남(법통)노회는 총회와 관계 없는 것으로 선포가 되었다.
9. 8

 총회측에서는 한상동목사에게 그가 시무하던 부산초량교회의 명도를 요구하였고,한상동목사는 10. 14 초량교회를 떠나니 90% 이상의 교인들이 따르게 되어 초량에 있는 주영문장로 뜰에서 예배를 드리게 되고 교회가 시작되니 삼일교회였다.
4. 29
 제37회 총회는 고려신학교와 그 관계자들(경남(법통)노회)은 총회와 하등의 관계가 없다는 총회측의 재언명과 경남(법통)노회의 엄주신 장로의 고별선언을 최후로 고려학교를 중심한 경남(법통)노회는 총회와 결별이 되었다.
이 때의 일을 김양선 목사가 쓴 [한국기독교 해방 10년사] p.159에는 다음과 같이 서술하였다. "대한 예수교 장로회 총회가 교회의 주권을 의식적으로 교권주의자에게 바친 때문에 일어난 일대 불상사들 이었다. 한국교회 70년사 상에 있어서 이때처럼 교권이 형세된 때는 없었다."
9. 11
 경남 진주 성남교회당에서 제1회 총노회가 조직되고 총노회 조직의 취지와 목적을 발표하였다.
취지 : 현 대한예수교장로회 총회는 본 장로회 정신을 떠나서 이교파적으로 흐르므로 이를 바로 잡아 참된 예수교장로회 총회를 계승하기 위하여 총노회를 조직한다.
목적 : 정통적인 대한예수교장로회 정신을 지지하는 전국교회를 규합하여 통합하며 개혁주의 신앙 운동을하며, 법통총회를 장차 계승키로 한다.
9. 22 신사참배 한 일에 대하여 목사, 장로, 남녀 전도사의 자숙기간을 3주간 정하고 공인죄와 자인죄를 통회자복하다.
3. 12 ① 미국개혁파장로회와 정통장로회와 성경장로회에 대표를 파송하다.
② 경북노회 조직
3. 13 경기, 전라노회 조직하다.
3. 8 송도에 고려신학교 교사신축(594평)을 시작하다.
9. 20 총노회가 총회로 개편키로 하고,회수는 총노회 회수를 계속키로 하다.
제6회 총회가 되었다. 이 때 총회 교회수 568, 목사 111명 세례교인수 15,350명, 박윤선 목사 개혁운동 10주년을 맞아 총회로 출발함에 있어서 과거 10년을 회고하면서 잘못된 것을 시정하고 새롭게 도약하는 것을 선언하다. 1957. 9. 19 제7회 총회에서
① 자유중국(대만)에 선교사 파송하기로 결의하고 김영진 선교사를 선정하다.
② 새찬송가 발간하기로 하고 편집위원 선정하다.
5. 13 김영진 선교사 자유중국에 파송되다.
9. 20 제10회 총회에서 승동측(NA)과 합통키로 하고 합통 추진위원 9명을 선정하다.
10. 박윤선 목사 주일성수 문제로 고려신학교 교수직 사면.
12. 13 승동측과 합동하고 제45회 총회로 하다. 기념으로 고신에서 편집하여온 새찬송가를 생명의 말씀사에서발행하다.
9. 20 제47회 총회(고신 12회)에서 고신측 지도자들이 총회 내의 상대방 처사에 불안감을 갖게 되다. 그 이유는 합동 원칙에서 어긋나기 때문에.
7. 29 부산노회 소속 교직자들 고신노회 환원 추진. 8. 8. 목사 23명, 장로 21명부산남교회당에서 부산노회 환원을 결정함. 8월 전라노회, 9. 3 경북노회 9. 4 경기노회, 9. 10 경남(법통)노회 환원.
9. 17 제13회 환원총회 회집되다.
합동위원 대표, 송상석, 황철도, 한상동 제 목사가 합동하게된 것을 하나님 앞과 교회 앞에 잘못된 것임을사과하고온 회원이 함께 회개하고 감사의 마음으로 사과를 받다.환원현황, 7개노회(부산, 경남, 경북, 전라, 진주, 경동) 교회수 445, 목사 116명.
9. 22 제14회 총회시 ① 고려학원을 총회가 직영하도록 하다.
② 고려고등성경학교(교장 오종덕목사)재산일 체를 총회에 헌납.
③ 고려신학교(이사장, 한상동목사) 재산 일체를 총회에 헌납.
9. 6 대한예수교장로회(고신)총회유지재단 인가 받음.
9. 20 고려신학교 설립 20주년 기념행사 갖고 주남선 목사 기념관 건립.
9. 22 제16회 총회시 목사 시무년한 70년 정년제 결의.
5. 17 학교법인 고려학원 문교부인가.
9. 19 제18회 총회에서 타교단 신학교를 졸업하고 본 교단에 가입하여 강도사 고시에 응하고저하면 고려신학교에 1년 이상 수학한 후에 응시하도록 한다.
7. 10 국방부장관으로 부터 군종장교 후보생 지정학교의 인가를 취득함.
9. 6 문교부장관으로부터 고려신학교를 대학 동등 학력인정 지정학교의 인가를 취득하다.
9. 15 제 19회 총회에서 목사, 장로, 집사 정년을 만 70세를 결의하다.
12. 30 문교부 장관으로부터 고려신학대학 인가 받음. 복음병원을 학교법인 고려학원 수익 기관으로 정함.
9. 23 제21회 총회에서 강단교류 문제는 국내외를 막론하고 칼빈주의 보수 교단으로 본교단 정신에 맞지 않는 교단을 거부키로.
9. 21 제22회 총회시 고려학원 이사장 송상석 목사의 임기가 만료되어 총회에서 이사를 선출하였으나 문교부의법정 기일이 남았다는 이유로 총회 결의에 순응하지 않으므로 총회가 이사를 전면 개편하 였다.
4. 23 경안노회 조직
9. 19 고려학원 이사회 문제가 계속 어려움을 겪어 오다가 세상 법정에 고소가 되고제24회에서는 이사장 처리를 위한 특별 재판국이 설치되다.
12. 4 이사장 송상석 목사를 특별 재판국에서 면직 판결함.
9. 25
① 이사장 문제로 경남노회가 양분이 되고,총회를 순복하는 경남노회측 총대를 경남노회 계승총대로 인정하고 총회가 받다.
② 총무제도 신설하기로 결의하다.
9. 23
① 제26회 총회에서 소송문제에 대한 천명 건의건은 [사회법정에서의 성도간의 소송은 부득이한 경우와 교회법에 불복하는 경우 외에는 하지 않는 것이 총회의 입장이다]로 천명하다. 소송을 반대했던 측은 총회를 떠나 별도 반고소란 이름으로 교단이 분열되다.
② 1대총무 : 민영완 목사 ③동부산노회 조직
2. 15 문교부장관으로부터 고려신학 대학원 인가를 받다.
9. 25
① 제 29회 총회시 의과대학 추진이 건의 되었으므로 의과대학은 현 고려신학대학을 개편하지 않을 것을 전제로 하고 현 이사회와 각노회에서 대표 1인씩 파송하여 함께 협력 연구 추진키로 하다.
② YFC를 CE로 명칭 변경.
9. 25
① 고려신학대학은 고신대학으로 명칭변경된 일에 학장이 사과하고 목회신학대학원 인가를 얻도록 교섭하기로 하다.
② 울산, 서울노회 조직
9. 24 제 31회 총회에서 교단사 편찬위원 선정하여 집필키로 하다.
교단창설기념주일 제정(9월둘째주일)
9. 23 제 32회 총회에서 소송문제로 나누어졌던 일은 피차 하나님 앞에 죄송스러운 것임을 승인하고 하나되다.
9. 22 제 33회 총회시 총회회관 건립을 위한 모금운동을 하기로 하다.
9. 20 교회와 노회가 개척한 교회들은 유지재단에 등기키로 하다.
9. 5 ① 교단주일. 9월 둘째주일로 정하다.
② 총회회관 건립을 유지재단이사회에 맡겨 진행하도록 하다.
7. 17 기독교보 복간되다.
9. 17 총회 전담 총무 두기로 하고 1년 후 실시하기로 하다. 경서노회 조직
3. 31
① 총회 회관 서울시 서초구 반포동 58-10 에 기공예배, 280평 대지, 지하2층 지상 7층 연건평 1266평.
② 경남중부, 경인노회 조직
9. 17 총회회관 준공예배.11.1 입주 이후 총회산하 모든 상비부가 총회 회관에서 업무를 수행 하고 있다.
9. 26 총회 선교부 전담 총무 두다.(이병길 목사)
6. 해방 50주년 기념행사를 30개 노회별로 실시하고 특별 연보하여 개척교회를 1개처씩 30개 노회가 일제히 세우기로 하다.
4. 26 천안캠퍼스 기공식 (고려신학대학원)
7. 8-11 총회 선교부 주최 세계선교대회를 개최하다 (장소:부산남교회)
10 46회 총회시 동대구, 전북노회 분리 (32개노회)
6. 24-25 제1회 '97 목사.장로 특별기도회 (부산삼일교회)
"정신을 차리고 근신하여 기도하라"(벧전4:11)
3. 2- 3 제2회 교단특별기도회 (전국여전도회관) "나라와 민족과 교단을 위하여"
8. 18-19 제3회 교단특별기도회 (전국여전도회관)
"하나님의 사람답게 살자"(출20:1-17)
8. 25 고려신학대학원 천안캠퍼스 준공예배
9. 49회 총회시 울산남노회 분리 (33개노회)
6. 단군상 철거를 위한 전국 궐기 대회(서울종묘공원)
9. 51회 총회시 서경노회 합동 (34개 노회)
9. 교단설립50주년 기념대회 개최(고려신학대학원)